在网站被挂马后，整个页面都会被篡改为对方的页面，如果不看源代码，很难察觉到问题所在，那么当发现网站被挂马后该如何处理呢？可参考如下：
1、扫描挂马的目录
扫描后将挂马文件删除，挂马文件会篡改页面内容，如果是生成文件则需要进行重新生成，如果是静态非生成文件，则需要把备份文件还原回去，如果没有备份文件我们则需要进行代码重新编辑删除被挂马篡改的部分内容。
2、程序目录查看修改时间
利用软件筛选出的挂马文件不一定是全部的文件，部分文件隐藏的比较深，这时候需要进行手动点开我们网站程序目录进行修改时间查看，一般日期比较不一致的都有可能是挂马文件的变形，这时候我们可以针对性的查看进行删除。
3、将网站安全加固
网站挂马清除后一定要记得将网站安全加固，首先文件用户权限是一个非常重要的操作，对于不需要进行写入修改的文件权限我们要进行文件权限修改为只读。
4、修复网站漏洞
很多网站经常采用别人的模板来建站或者是后台可能是市面上流传的一些通用后台例如织梦后台，帝国后台等等都可能纯在版本漏洞，建议升级到最新版。
5、网站上传审计
很多网站都有注册发帖功能，而很多都是通过这个漏洞进行上传篡改挂马文件，所以我们的网站在上传的这块功能上如果不是必须可以进行删除，或者对其发布上传的权限另外归档权限确保不会影响到本身网站。
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